specjalizuje się w badaniach bioróżnorodności konsorcjów mikrobiologicznych oraz cech adaptacyjnych umożliwiających mikroorganizmom rozwój w specyficznych warunkach środowiskowych. W ramach autorskiego projektu SONATA NCN będą prowadzone badania mikrobiomu głuszca, ze szczególnym uwzględnieniem cech fenotypowych pozwalających na trawienie biomasy igliwia. Badania mikroprzepływowe zostaną skorelowane z technikami, takimi jak wysokoprzepustowe sekwencjonowanie nowej generacji oraz klasyczne metody mikrobiologiczne, które wykorzystane były w poprzednich projektach dotyczących mikrobiomu w kontekście produkcji biogazu, deterioracji materiałów, biocementacji oraz oporności mikroorganizmów na metale ciężkie.
Warsztaty skierowane są do studentów zainteresowanych nowoczesnymi metodami analizy mikroorganizmów z wykorzystaniem wysokoprzepustowych technologii mikroprzepływowych, znajdujących zastosowanie w biologii, biotechnologii oraz medycynie.
W części teoretycznej uczestnicy zapoznają się z podstawami mikrofluidyki, typami stosowanych formatów prowadzenia reakcji (tj. krople, mikrokapsułki), a także dostępnymi modułami (np. pikoiniekcja, sortowanie). Omówione zostaną zalety tej technologii oraz jej rozwój w badaniach mikrobiomu — zarówno w kontekście analiz pojedynczych komórek, jak i badań meta-omicznych. Część praktyczna obejmuje przygotowanie chipów, tworzenie i depozycję kropli z bakteriami, enkapsulację w kapsułkach oraz obserwację przygotowanych układów pod mikroskopem.
Uczestnicy warsztatu:
| Maksymilian Stachów | Alicja Semeniuk | Jakub Górniak |
|---|---|---|
| Antoni Białek | Izabela Bedzyk | Jakub Dziczkowski |
| Małgorzata Batorowska | Aleksandra Maśka | Dominika Łukomska |
| Artur Chojnacki | Maja Prochowska | Katarzyna Bylina |
| Filip Jankowski |